首先，治疗造成硫胺素缺乏的原发疾病诱因，如消化道疾病、糖尿病、甲状腺机能亢十进等。
12.6.1 脚气病的治疗
饮食：宜用含硫胺素丰富的高蛋白低盐饮食。蛋白质每日100～150g，但碳水化物的量不宜多。
应用硫胺素：病情轻的或干型脚气病，口服硫胺素，一日3次，每次5mg 。
重者肌注或静注硫胺素一日2次，每次10mg。到病十性十缓解后，可改为口服，用量同上。
暴发型：首次静注硫胺素20mg，其后每4小时肌注10mg、直到可改为口服，每日10mg。假如婴儿吃人十奶十，对哺十乳十者应给硫胺素治疗，每日2次，每日10mg，注射或口服均可。
辅助药物治疗：酵母4～20g或用复合维生素B。
一般治疗：卧十床十休息以及对症治疗。
12.6.2 与硫胺素有关疾病的治疗
慢十性十乙醇中毒神经炎：每日口服硫胺素10mg，2～3日内就能收到良好疗效。
妊十娠十性十神经炎：每日口服硫胺素5～10mg。呕吐时可注射。
心血管疾病：小动脉扩张而引起的血流量增加。用硫胺素后几小时内血流速度就可减低，同时由于循环改善，氧利用率也增加。口服硫胺素每日3次，每次5mg。
多种维生素缺乏：很多膳食不当的人可以遭到复合维生素B族中几种以上成分的缺乏。例如用菸酸治疗癞皮病人：当癞皮病治疗愈后，则又出现显著的脚气病症状。因此在治疗维生素缺乏症时，给与几种维生素B的复合制剂是必要的。
胃肠疾患：引起吸收量不足的肠道疾病如慢十性十腹泻，可给硫胺素以防止硫胺素缺乏症的发生。此办法也同样适用于小肠切除或有肠瘘的病人。
12.6.3 硫胺素衍生物的应用
应用最广泛的是硫胺素的丙基二硫化物（thiamin propyl disulfide,TPD）与硫胺素四氢化糠醛二硫化物（thiamin terahydrofurpuraldisulfide,TTFD），这些药物在水中溶解度很低，而且被硫胺素酶分解极微。甚至口服也比硫胺素盐酸盐在血、组织与脑脊髓液中产生的硫胺素水平高。酒十精十中毒患者口服TPD比口服硫胺素盐酸盐，在纠正生化与临十床十缺乏症状的效果更为明显。对亚急十性十坏死十性十脑脊髓病（CNE）治疗的初步报告指出，TPD与TTFD比硫胺素盐酸盐更能升高脑脊液中的硫胺素水平。因SNE的缓解与脑脊液中的硫胺素的高水平有密切关系。故临十床十上用TPD或TTFD来治疗这类病人。