庾荜，字休野，是新野人。他的父亲庾深之，官至南朝宋雍州刺史。
庾荜十岁那年，遭逢他父亲的丧事，他守孝时哀毁不已，深受州里官员称许。二十岁左右，庾荜被州里迎为主簿，举荐为秀才，数次升任安西主簿、尚书殿中郎、骠骑功曹史等职。庾荜博览群书，口若悬河，很有才华。南朝齐永明年间，朝廷与北魏和亲，任命庾荜兼任散骑常侍，作为报聘使者，回朝后，庾荜被授予散骑侍郎之职，主持东宫事务，管记事。
郁林王萧昭业即位不久，就被废掉了，庾荜掌管中书，起草命令和文告，出任荆州别驾之职。又调任西中郎将咨议参军，后来官复原职，担任荆州别驾。前前后后的荆州别驾，都发了大财，庾荜两次担任这一职务，都以身作则，廉洁奉公，不请客送礼，穿的是布衣，吃的是粗茶淡饭，妻子儿女都难免有饥寒之苦。齐明帝闻知他的事迹，称赞不已，写了手谕对他进行褒奖，于是州里把庾荜引为荣耀。
此后，庾荜升任司徒咨议参军、通直散骑常侍之职。梁武帝平定京城，建立霸业，庾荜被任用为骠骑功曹参军，又调任尚书左丞。出任辅国长史、会稽郡丞、行郡府事。当时正值战乱之后，经济凋敝，老百姓田中歉收，会稽郡谷价昂贵，一担米价格涨到数千钱，民户流亡的很多。庾荜抚一慰百姓，颇有成绩。他平时就只领取鲍家给他的那份俸禄，清正廉洁，此时对自己要求更加严格，甚至有时候家里一整天不生火。会稽太守永一陽一王闻知此事，便赠送一些东西给他。可庾荜极力推辞，不肯接受。天监元年(502)，庾荜去世，因家中没有钱，一尸一体停在那里没法更衣下棺，灵柩也买不回来。梁武帝听说了这件事，下诏赏赐绢一百匹，米五十斛。
起初，庾荜因为家族是西楚一带有名望的世家大族，他自己又很年轻便担任比较显赫的官职，因而遭人嫉妒。他的同乡人乐蔼很有才干，平常和他不和，互相争逐。乐蔼在齐朝豫章王萧嶷手下为官，后来萧嶷去世，乐蔼为官不得其志，由步兵校尉任上请求回到荆州协助防守，当时庾荜任荆州别驾，更加瞧不起乐蔼。等到梁武帝即位，乐蔼因西朝之功升任御史中丞，而庾荜这时候才担任会稽郡行一事，心中已经感到耻辱了，正好碰上庾荜在职事上有一些小饼失，梁武帝看到乐蔼是他的同乡，便叫乐蔼去传达自己的旨意，教训教训庾荜。庾荜忿恨不已，因而发病离开了人世。