邢云飞是河北顺天府人，喜欢玩赏石头，见到形态特别优美的玩石，自己从不惜代价收买。一次，偶然到河中打鱼，水中有一块东西把网挂住了。他潜伏到水底把它捞上来，一看，是块尺把长的方石头，四面玲珑剔透，峰峦叠起，秀美异常。邢云飞非常高兴，如同得到了无价的珍宝。带到家中，用紫檀木雕了一个底座，把石头安在上边。陈设在桌子上。每当天将下雨的时候，石头的每一个细孔中，都有云烟生出，远处观望，如同在上面塞了白色的棉絮。
一个有权势的土豪，来到邢云飞家中，要求观看一下石头；他一见到石头，就把石头递到健仆手中，策马扬鞭而去。邢云飞无可奈何，只有顿足悲愤罢了。那仆人扛着石头走到河边，将石头放在桥上休息，忽然失手，石头掉到河中。土豪愤怒地用鞭子抽打仆人，马上出钱雇佣善长水性的人，到水中打捞。但是，他们想尽一切办法，到处搜寻，始终没有见到。最后，只好贴了一个愿出重金悬赏打捞石头的约书，就走了。自此以后，到水中打捞石头的人，每天都把河挤满了，最终仍然没有一个人得到。后来，邢云飞来到石头掉落的地方，望着滔滔的河水呜咽悲泣。只见河水清澈见底，而石头仍然还在水中。邢云飞大喜，脱去衣服跃入水中，抱着石头从河底浮出，把它带回家，再不敢将石头摆放在客厅中，就另打扫一间清洁的屋子，把石头陈设在那里。
一天，忽然来了一位老头敲门，要求看一看石头，邢云飞假托说石头已经丢失了。老头笑着说：“客厅里陈设着的不是吗？”邢云飞便把他请到客厅里，以证实确是丢失了。等到老头子与邢云飞走到客厅里，那块石头果然陈没在客厅的几案上。邢云飞惊愕地说不上话来。老头子用手抚摸着石头说：“这是我家的旧物，丢失了已经很久了，今天才知道它原来在这里。我既然找到了，那就请你归还我吧！”邢云飞很窘迫，便与老头子争论谁是石头的真正主人。老头子笑道：“既然是你家的东西，有什么验证？”邢云飞回答不上来。老头笑说：“我本来就识得，此石前后共有九十二个孔窍。那个大孔中有五个字，是：‘清虚天石供’”邢云飞细细审视，果然如同老头说的，孔窍中刻有小字，细如粟粒。只有仔细看，才能辨认清楚；又数它的孔窍，也像老头子说的那样。邢云飞没有话说，只是执意不给。老头笑着说：“谁家的东西，凭你来作主啊。”拱拱手便走了。邢云飞把他送出门去；回到屋里一看，石头不见了，大吃一惊。心疑是老头干的，急忙去追赶老头。而老头在慢慢地走着，还未走远。跑上前去拉着他的袖子苦苦哀求。老头说：“奇怪啊！那么一块大石头，能用手握着藏到袖子里吗？”邢云飞知道老头子是神人，强拉着他回来，跪在他面前请求还给他。老头就问：“这块石头，究竟是你家的，还是我家的？”邢云飞说：“确实是属先生你的，但我求先生割爱啊！”老头说：“既然是这样，那么石头本来就在这里。”邢云飞进到内室，则石头仍然放在那里。老头说：“天下的宝物，应该给与那些真正爱惜的人。这块石头能自己选择主人，老汉我也高兴啊。然而这块石头急于自我显露，他出世过早，而恶劫的运气还未消除。我确实是想把它带走，等三年后再奉赠你。但是，既然你一定想留下，应当减少你三年的寿数，这样这块石头才能自始至终与你相伴，你愿意吗？”邢云飞说：“愿意。”老头于是用手指捏石头的孔窍，石窍像泥一样软，随手闭塞。老头捏闭三窍，说：“石头上的孔窍数，也就是你的寿数。”老头子欲去，邢云飞苦苦地挽留他，但老头坚决辞别；邢云飞问他姓字，他也不说，就去了。
时间过了一年，邢云飞因为有事出门去，夜间有小偷到他的房问，别的什么东西也没丢失，惟独把那块石头偷了去。邢云飞回来，见石头丢失，悲痛伤心得要死。他到处访察、购求，但没有一点踪影和头绪。又过了几年，偶然到报国寺去，见到有卖石头的，走近一看，就是自己丢失的那块石头，邢云飞准备认走自己的石头。但卖石头的很不服，因而扛着石头告到官府。官府问：“你有什么证据啊？”卖石头的能说清楚石头上的孔窍数。邢又问卖石头的其它特征，却茫茫然说不出来了。邢云飞寻于是说明这石头窍中的五个字及三个孔窍被捏闭的指痕。邢云飞的情理，得到伸张。当官的于是想以棍杖责打卖石头的人，卖石头的人解释说，这是他用二十两银子在集市上买来的，这才把他放了。邢云飞得到石头后，用锦帛把石头包裹起来，藏在木柜子中，偶尔观赏，必先烧香以后才拿出来。
有一位尚书，想花百两银子的价格购买邢云飞的石头。但邢云飞回答：“就是万两黄金也不卖。”尚书很生气，就借故其它的事，陷害邢云飞，把他关在监狱里。为了把邢云飞救出来，家里人便典卖田产。尚书于是托人传话给邢云飞的儿子，儿子又把情况告诉了邢云飞，邢云飞宁愿以死殉石，也决不给这个尚书。邢云飞的妻子于是与他的儿子偷偷商量，把石头献给了这个尚书。邢云飞出狱以后才知道这件事，他骂妻子打儿子，屡次想自杀，都被家人觉察而未死成。一天，夜间，邢云飞梦见一伟丈夫来，自称是：“石清虚。”告诉邢说：“不要难过。我只不过与君分别年余。明年八月二十日清晨，可到崇文门，用两贯钱就可赎回来。”邢云飞得到这个梦示后，很高兴，特别记住这个日子。再说那块石头到尚书家以后，再也没有孔窍出烟雾的灵异，时间一久，尚书也就不以此石为珍贵。第二年，这位尚书以获罪而被削职，接着就死了。邢云飞按期到崇文门，尚书家中人把石头偷出来，正在寻找买主，邢云飞见了用两贯钱买了回来。
后来，邢云飞八十九岁了，就自己准备好送葬的寿材、寿衣，又嘱咐自己的儿子，必定用这块石头殉葬。不久，邢云飞果然死了，他儿子就遵照他生前遗嘱，把石头给埋到坟里。大概过了半年时间，小偷把坟墓挖开，把石头盗走了。邢云飞的儿子知道了，但也无法去搜查寻找。过了二三天．邢云飞的儿子携带着仆人走在路上，忽然见到两个人，跌跌撞撞，满头大汗，对着天空自已认罪说：“邢先生，不要相逼，我二人把石头拿去，不过卖了四两银子罢了。”邢云飞的儿子便捉住两个偷石者，送到官府，一审讯就伏罪了。问石头哪里去了，说已经卖给一位姓宫的了。把石头取回来，长官玩弄着爱不释手，竟想得到这块石头，命令把石头寄存在官库中。差役把石头举起，忽然石头掉在地上，碎成几十片，众人无不失色。长官于是就用重刑处死了两个偷盗石头的贼。邢云飞的儿子将石头的碎片拾起，回去后，仍然埋到邢云飞的坟里。